申请两年分居自动离婚是不可以的。想要离婚最起码要有重婚的违法情况，或者出现了暴力等犯罪行为等情况才能协议或者去法院起诉离婚。依据我国法律规定，双方感情破裂，可以直接办理离婚手续，如果双方对财产分割、子女抚养等达不成一致意见的，可起诉到法院离婚。对于分居多久才可以离婚，法律是没有规定，不论分居多长时间，如果双方都不提出离婚，婚姻不会自动解除的。如果起诉到法院离婚，分居满2年，法院会支持离婚。
判定感情确已破裂的标准，我国现行的《婚姻法》第32条列举了下列五种具体情形：
(1)重婚或有配偶者与他人同居的
重婚指有配偶者又与他人登记结婚或者与他人以夫妻名义共同生活。有配偶者与他人同居是指有配偶者与婚外异性，不以夫妻名义，持续、稳定地共同生活。这两种行为都是违反《婚姻法》一夫一妻原则、破坏婚姻秩序地严重过错行为。夫妻一方重婚或者与他人同居的，经调解无效，应当认为夫妻感情确已破裂。
(2)实施家庭暴力或虐待、遗弃家庭成员
《婚姻法》所称的“家庭暴力”是指行为人以殴打、捆绑、残害、强行限制人身自由或者其他手段，给其家庭成员的身体、精神等方面造成一定伤害后果的行为。持续性、经常性的家庭暴力，构成虐待，情节严重的构成刑事犯罪的，还应当依法追究其刑事责任。遗弃是指对其家庭成员负有抚养义务而拒不履行抚养义务的行为，情节严重的，同样应当承担刑事责任。实施家庭暴力或者虐待遗弃家庭成员的行为人为夫妻一方，受害人则不限于其配偶，也包括其他家庭成员。《婚姻法解释(一)》对家庭暴力的构成确定了严格的标准，即“须给其家庭成员的身体、精神等方面造成一定伤害后果”，达到这样的程度才可认定为家庭暴力，这将家庭成员间日常吵架、偶尔打闹以及尚未造成后果的家庭纠纷排除在家庭暴力之外。一方以其配偶有家庭暴力或虐待遗弃家庭成员的行为提出离婚，经查证属实，调解无效的，应当予以支持。如配偶一方长期地对子女或者老人实施家庭暴力或者虐待、遗弃子女、老人等，并给其家庭成员的身体、精神等方面造成一定伤害后果，导致夫妻感情破裂的，另一方可以向法院起诉离婚，法院经调解无效的，应当准予离婚。
(3)有赌博、吸毒等恶习屡教不改的
这里所指的并非一般的赌博、吸毒行为，而必须是达到已成恶习且屡教不改的地步。本款为例示性规范，除了明确列举的赌博、吸毒恶习之外，还应包括其他会严重危害夫妻感情的恶习，诸如酗酒、嫖娼、卖淫、淫乱等。一方当事人以其配偶有该法定过错而提出离婚请求，只要调解无效，就应依法予以支持。
(4)因感情不和分居满二年的
我国《婚姻法》此款规定有两个要件：
①双方分居的原因只能是感情不和，不包括因客观原因的分居，如因为工作原因或者出国留学导致两人分居;
②分居的时间已满二年，且该二年分居时间应该是不间断的、持续的，如有间断，应当从最后一次同居之日起重新计算两面二年的时间。符合这二个要件，经调解无效，可认定夫妻感情确已破裂。
(5)一方被宣告失踪，另一方提出离婚诉讼的
《民法通则》第20条规定，公民下落不明满二年的，利害关系人可以向人民法院申请宣告他为失踪人。《婚姻法》规定：“一方被宣告失踪，另一方提出离婚诉讼的，应准予离婚。”主要是考虑到失踪一方下落不明，无法履行夫妻义务及家庭义务，说明其夫妻感情确已破裂。适用该条款时要注意：
①一方必须是被依法宣告失踪，而不是未经宣告的事实失踪。
②应一方被宣告失踪而请求离婚的，必须通过诉讼程序才能解除婚姻关系。
由于被告缺席，因此，人民法院审理这样的离 婚案件无需进行调解，而可以直接判决准予离婚。
综上所述，夫妻的感情是婚姻联系以及法官在断定其是否具备离婚事实的重要依据，所以就算夫妻分开住很长时间也没有办法证明夫妻双方的离婚事实，只有通过起诉得到的判决或者双方一起去了民政局登记其离婚事实才是唯一有效的离婚措施。
