1.定义不同：
①自诉指被害人、或其法定代理人、近亲属为追究被告人的刑事责任，直接向司法机关提起诉讼，并由司法机关直接受理的刑事案件。
②公诉是指人民检察院对犯罪嫌疑人的犯罪行为向人民法院提出控告，要求法院通过审判确定犯罪事实、惩罚犯罪人的诉讼活动。
2.提起诉讼主体不同：
①自诉是当事人自己提起的诉讼，公诉是检察院依职权主动提起的诉讼。
②公诉是由检察院代表国家向法院起诉，要求追究加害人的刑事责任。
3.提起诉讼条件不同：
①自诉条件：有适格的自诉人;有明确的被告人和具体的诉讼请求;属于自诉案件范围;被害人有证据证明;属于受诉人民法院管辖。
②公诉条件：犯罪嫌疑人的犯罪事实已经查清;证据确实、充分;依法应当追究刑事责任。
二、自诉案件的处理方式有哪几种?
《刑事诉讼法》第172条规定，人民法院对自诉案件，可以进行调解;自诉人在宣告判决前，可以同被告人自行和解或者撤回自诉。根据该条规定，自诉案件有4种处理方式：
1、调解。
2、当事人在庭外自行和解。
3、撤回自诉。
4、判决。
值得一提的是，按《刑事诉讼法》第170条第3项规定审理的自诉案件不适用调解。这是因为这类案件原属公诉案件，只是被害人依法向公安机关或者人民检察院举报、控告后，公安机关不予立案，或者人民检察院已决定对被告人不予起诉或者仍维持对被告人不予起诉的决定，但被害人有证据证明能够追究被告人的刑事责任而不得已直接向法院起诉，因而人民法院审理这类案件时不能进行调解。
提起自诉，被害人或其法定代理人、近亲属以及他们的诉讼代理人在法定的起诉时效期限内，可以用书面或口头的方式直接向有管辖权的人民法院提出。自诉一般用书面的形式，即应当制作并向法院呈递刑事自诉状。但是，自诉人书写自诉状确有困难的，可以口头告诉，由人民法院工作人员作出告诉笔录，向自诉人宣读，自诉人确认无误后，应当签名或盖章。
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