独立核算分公司由分公司本身进行账务处理、向税务机关纳税申报。
非独立核算分公司由分公司进行账务处理，纳税申报时应将账务数据并入集团公司，由集团公司汇总向税务机关纳税申报。
独立核算是指对本单位的业务经营活动过程及其成果进行全面、系统的会计核算。独立核算单位的特点是：在管理上有独立的组织形式，具有一定数量的资金，在当地银行开户;独立进行经营活动，能同其他单位订立经济合同;独立计算盈亏，单独设置会计机构并配备会计人员，并有完整的会计工作组织体系。非独立核算是指没有完整的会计凭证和会计账簿体系，只记录部分经济业务的单位所进行的会计核算。 实行非独立核算的单位称为非独立核算单位，又称报账单位，它本身没有资本，其财产物资由上级单位拨付，也没有独立的银行账户，其一切收入均存入上级单位账户，一切支出也由上级单位审核支付。非独立核算单位通常不设置会计机构，仅配备会计人员进行原始凭证的填制、审核、整理和汇总，以及实物明细账的登记工作，不单独编制预算和计算盈亏。在具体的税务申报上，对于地税、国 税的申报，只是在所得税方面有差异，后者可以在总部交，其他的应该没有多大差异了!.
2、地税税种是就地缴纳。所得税。按照新所得税法。新企业所得税法第五十条和第五十一条分别规定，居民企业在中国境内设立不具有法人资格的营业机构，应当汇总纳税。分支机构按照总机构提供的分配单来缴纳所得税。
3、不管你独立核算，还是非独立核算。如果缴纳地税的话，不可以汇总纳税的。必须在当地缴纳。
4、如果你缴纳增值税，一般原则是，跨县的企业是经市局批，跨市的经所在省局批，跨省的经总局批，才可以汇总缴纳。
分公司独立核算和非独立核算的区别在于财务管理。两者在计算账务处理和向税务机关那谁申报方面有所不同。实际上，独立核算是对于公司经济成果的会计核算。而非独立核算没有资本，简单来讲非独立核算更像是报账单位，更多相关问题您可以咨询律图律师。
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