公司罚款不合法，因为公司是企业没有罚款权。如果给公司造成损失的，在损失范围内公司可以要求赔偿。赔偿数额仅限于补偿给公司造成的损失，不能超出这个数额。如果是从工资里扣的话，当月扣除数额一般不能超过工资20%，当月扣不完的分摊到以后月份。
公司不属于行政机关，不能对员工罚款。员工工作时出现过错，公司想要处罚员工的，可以采取以下办法：在劳动合同中约定员工未完成劳动定额或承包任务，公司可以发放最低工资;以奖代惩，跟员工约定奖金的获得规则等等。若是公司对犯有过错的员工未按以上形式等等，员工被罚款后，可以去申请劳动仲裁处理。《行政处罚法》规定，劳动法上的用人单位不是行政执法机关，无权对职工的违法行为进行罚款。
不论逾期费用还是罚工资，其实都是对员工的处罚。一般来说，用人单位是无权这样做的。除非单位规章制度有明确规定，而且经过合法的程序通过，对该员工有效。
再者，逾期不缴纳罚款的收取滞纳金，在处罚文书中一定要注明限缴期限和逾期的法律后果。也就是说处罚文书的若存在法律瑕疵，也是有责任的。若不选择向处罚部门复议诉讼，单位内部也可对此划分相应的责任。
《工资支付暂行规定》第十六条规定：“因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付”。
公司不可以对员工进行处罚，这违反行政保护法规定，劳务者对公司存在疑虑不满，可以根据规矩合同签订，来保护自己的合法权益。对员工进行的处罚，也要符合公司管理规定和保护条例。
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