1、立案
2、调查取证
职能部门派出调查人员(不少于2人)进行调查取证，应主动出示执法证件。调查要制作笔录，询问应个别进行。需要监测的，要制作监测结果报告，并由监测单位盖章和监测人员签名。
3、审议
经调查后确定不需作出行政处罚的案件，职能部门要填写《撤销立案审批表》交法制股，经分管局长签署意见后归档。
4、听取申辩与听证。
在《行政处罚决定书》下达3日前，职能部门的调查人员制作《行政处罚事先告知书》告知当事人违法事实、处罚依据、拟作出的处罚，以及当事人享有的陈述、申辩权利，制作“申辩笔录”。
对责令停止生产或使用、吊销许可证或者对个人处以3000元以上、对法人或其他组织处以10000元以上罚款等重大行政处罚的，告知当事人有权要求听证，其申请须在被告知3日内提出。
听证按《行政处罚法》和《环境保护行政处罚办法》规定的程序进行。
听证主持人由法制股非本案调查人员担任，职能部门的调查人员参加。
5、签发
法制股根据审议、申辩与听证结果，责成监察大队制作《行政处罚决定书》，由局长签发。
6、送达
7、执行
当事人逾期不申请复议，不提起诉讼，又不执行的，由职能部门告知法制股，经局长同意后由监察大队负责承办申请法院强制执行的具体事宜。
8、归档
案件终结，由执行处罚的监察大队及时写出结案报告。
案件办结后，办案人员应交协案过程中形成的材料立卷归档。
根据《环境行政处罚办法》第10条，根据法律、行政法规和部门规章，环境行政处罚的种类有：
（一）警告；
（二）罚款；
（三）责令停产整顿；
（四）责令停产、停业、关闭；
（五）暂扣、吊销许可证或者其他具有许可性质的证件；
（六）没收违法所得、没收非法财物；
（七）行政拘留；
所有行政违法案件的行政处罚流程都是一样的，所以环保局也不例外，进行口头警告或者对个人罚款在50元以下的，类似于这种比较轻微的违法案件，由执法人员现场处理。
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