仲裁协议的异议，在实践中主要是两种情形，一是对仲裁协议是否存在有异议，二是对仲裁协议是否有效存在异议，正是因为存在两种情况就需要区别对待了。
第一、须由当事人自己提出异议。仲裁协议事关当事人对诉权的处理，其效力牵涉到当事人的重大利益，故对仲裁协议的异议须由当事人自己提出。
第二、须由当事人向仲裁委员会或者人民法院提出。当事人可以向仲裁委员会提出异议，也可以向人民法院提出异议。
第三、应当在仲裁庭首次开庭前提出。依照仲裁法和民事诉讼法的规定，如果仲裁协议无效，将导致仲裁裁决被法院撤销或不予执行。
《中华人民共和国仲裁法》
第十六条 仲裁协议包括合同中订立的仲裁条款和以其他书面方式在纠纷发生前或者纠纷发生后达成的请求仲裁的协议。 仲裁协议应当具有下列内容: (一)请求仲裁的意思表示; (二)仲裁事项; (三)选定的仲裁委员会。
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