修建房屋或者厂房，按照规定都必须有国有土地使用证，修建的建筑物的层数和面积都必须按照土地使用证规定的数额修建，但是在建筑物修建时，有些人为了利用土地谋取更多的利润，往往会出现，明明土地使用证显示三层但是在修建时偏偏多修建几层，超出了土地使用证上面登记的面积，对此很多人不以为然，以为不会收到处罚。
2、根据《中华人民共和国土地管理法实施条例》，国家依法实行土地登记发证制度。依法登记的土地所有权和土地使用权受法律保护，任何单位和个人不得侵犯。可见，土地使用证在中国是确认土地使用权的法律凭证。中国的土地分为农民集体所有土地和国家所有土地，所以土地使用证也包括农民集体所有土地使用权证和国有土地使用权证。
3、土地登记内容和土地权属证书式样由国务院土地行政主管部门统一规定。证内各项数据和编号，如单位名称、四至、土地数量、位置、土地变更等，必须与土地登记表相一致。土地使用证附图可根据土地利用现状底图或地籍图透绘获得。随着面积和界线的变更，附图也应作相应改动。
4、国有土地使用证由国家土地管理局统一监制，市、县人民政府颁发，土地管理机关填写，发给依法使用国有土地的单位和个人，并由其保存。其主要内容包括：
①土地使用者名称、地址、图号、地号、用途、批准使用期限、四至、填发机关签章、年、月、日。
②城镇土地使用中用地面积，其中建筑占地，共有使用权面积，其中分摊面积，土地等级;农村土地中土地总面积，其中地类面积。
③备注。
④变更记事。
⑤附图以及证书的编号等。
1、如果土地是宅基地，那么要到村委会那里出证明，变更土地面积，然后拿证明和宅基地土地证到国土部门，办理变更宅基地面积土地证。然后再拿变更面积后的土地证到房管局办理宅基地房产证。
2、如果土地是国有土地，那么，是办理不了。超出面积的房屋是违法建筑，要被强行拆除的。只能把建造的房屋改建在土地证面积内，这样你才可以办理到房产证。
修建房屋时，如果土地使用证显示三层但是超出了，在农村自家的宅基地可以到村委会、国土部门等等办理宅基地面积变更，但是如果是国有土地使用证，土地使用证显示三层超出的部门就会按照违法建筑进行处罚，处罚的后果就是把违法建筑进行强制性拆除，而且建造的房屋面积和土地使用证上面的不一样也不可以办理房产证，无法上市交易。
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