按照《中华人民共和国印花税暂行条例》及其实施细则以及相关文件的规定，从2006年12月27日起，纳税人签订《国有土地出让合同》支付土地出让金应按照“产权转移书据”税目，按照万分之五的税率征收印花税。 因此，公司签订的土地使用权出让合同须缴纳印花税，税率为合同所载金额的万分之五。
土地使用权产权转移合同适用0.5‰税率。
1）比例税率
在印花税的13个税目中，各类合同以及具有合同性质的凭证（含以电子形式签订的各类应税凭证），产权转移书据，营业账簿中记载资金的账簿，适用比例税率。印花税税率分4个档次：
①借款合同，适用0.05‰税率；
②购销合同，建筑安装工程承包合同，技术合同，适用0.3‰税率；
③加工承揽合同，建设工程勘察设计合同，货物运输合同，产权转移书据或合同，营业账簿中记载资金的账簿，适用0.5‰税率；
④财产租赁合同，仓储保管合同，财产保险合同，股权转让书据（包括A股和B股），适用1‰税率；
2）定额税率
在印花税的13个税目中，“权利，许可证照”和“营业账簿”税目中的其他账簿，适用定额税率，均为按件贴花，每件税额为5元。
根据相关规定,办理土地使用权转让要交的税费包括:
二、营业税及附加(出让方):
1、按转让价与购置价的差价缴纳5%的营业税。
2、按缴纳的营业税缴纳7%的城建税和3%的费附加。
三、印花税和契税(双方):
1、按产权转移书据(合同)所载金额缴纳0.05%的印花税。
2、按成交价格(合同)缴纳3%的契税(有的地方是5%)。
四、土地税(出让方):
1、按取得收入减除规定扣除项目金额后的额,缴纳土地税。
2、规定扣除项目:取得土地使用权所支付的金额;开发土地的成本、费用;与转让房地产有关的税金等。
3、税率的确定四档:额未超过扣除项目金额的50%的部分,税率为30%;额超过扣除项目金额的50%至100%的,税率为40%;额超过扣除项目金额的100%至200%的,税率为50%;额超过扣除项目金额200%的,税率为60%。为计算方便,可以通过速算公式计算:土地税税额=额*税率-扣除项目金额*速算扣除系数(0、5%、15%、35%分别对应30%、40%、50%、60%税率)。
土地使用权转让过程中，需要缴纳的土地使用权转让印花税税率一般为总金额的0.05%。印花税税率有两种计算方法，一种是比例税率，即缴纳0.05%，另一种是定额税率，每件账目收取五块印花税。而土地使用权的印花税采用第一种缴纳方法。
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