围产期处理强调从胎儿到新生儿的过程一定要无缝衔接，即在分娩前后由专业的新生儿专家做好预案，为有消化系统疾病的新生儿做出应对处理，并能够随机应变。胎儿出生后的一小时十分重要，它将承载从胎儿到新生儿的生命转变，也是人生的开始。这一衔接过程若能做好，可以大大减少新生儿早期的并发症，如胎儿出生时需要根据羊水情况采取积极的干预措施，即在胎儿出生尚未呼吸和断脐之前，尽可能将其口腔和气道内过多的羊水吸净，减少和避免吸入性肺炎的发生。这个过程需要产科和新生儿科的共同协作，国内多有新生儿专业医生到产房直接处理早产或围产高危儿的举措。因此孕妇在选择分娩医院时，应尽可能选择有新生儿专业或有较强新生儿处理能力的医院。
关于产前诊断口咽部畸形的报道较少，但是如果存在的话，这些诊断信息将在新生儿出生时给新生儿科医生非常有用的帮助。口咽部畸形可以导致新生儿通气困难甚至窒息，需要在产时或生后一小时内处理。对于喉部囊肿或闭锁等上呼吸道罕见的致死性畸形，需要产前明确诊断并实施产时胎儿手术，确保胎儿出生后的呼吸道畅通。
新生儿若不出现肠梗阻表现，多不需要处理。对于明确的胎儿肠梗阻，胎儿出生后多会出现腹部膨隆、肠管充气扩张等症状，需要做常规胃肠减压处理，如肠闭锁、胎粪性腹膜炎等造成的上消化道梗阻经常有症状急、呕吐频繁、便闭等症状，需要及时做胃肠减压处理，控制饮食。可做腹部平片、系统超声和CT检查等尽快明确诊断。而对于巨结肠、肛门直肠畸形等造成的下消化道梗阻，则症状表现相对缓和，症状可以随着时间增长逐渐表现出来，可以在胎儿出生后根据具体症状做出相应处理。
围产期处理的好坏，直接体现了胎儿医学的精神和实质，它是当前产科和新生儿科如何达到密切协作的一个标志，也是实现和完善胎儿医学的必经之路。
