按作战任务分类
战略导弹：是用于遂行战徊任务的导弹。通常使用核战斗部，由国家最高统帅部直接掌握，用来摧毁敌方纵深内重要战略目标。
战术导弹：是用于遂行战术任务的导弹。主要用于打击敌方战役、战术纵深内的核袭击兵器、集结的部队、重要的军事设施，以及坦克、飞机、舰船、交通和通信枢纽等重要目标。亦可用于直接支援地面部队作战。
按飞行轨迹分类
弹道式导弹：它的飞行轨迹除了很小一段是发动机工作段之外，大部分是靠惯性飞行的自由抛射体弹道。
飞航式导弹（巡航导弹）：导弹上装有翼面，依靠发动机推力和翼面的气动升力，在稠密的大气层中飞行，整个飞行过程中发动机和制导系统一直工作。
按制导方式分类
寻的制导：雷达制导、红外制导、毫米波制导、电视制导、激光制导 ，寻的制导还分为主动寻的制导、半主动寻的制导、被动寻的制导。优点是精度高，但容易受干扰，适用点攻击。
自主制导：惯性制导（INS）、程序制导、地形匹配制导、星光（天文）制导、GPS制导。优点是抗干扰性强，弱点是精度不高，适用远距大目标的攻击。
遥控制导：按传输方式：指令制导和波束制导，指令制导分为无线电指令、有线电指令，波束制导分为雷达波束制导和激光波束制导。优点是设备简单成本低，还可以对付多个目标，弱点是使用有局限性。
复合制导： 同一武器上采用两种或两种以上制导方式组合而成的制导技术。特点是提高效率，但成本高，技术较复杂。
按发射点和攻击目标位置分类
西方国家一般把地面和水面、水下统称为面，所以他们的导弹一般被分为面面导弹（SSM）、面空导弹（SAM）、空面导弹（ASM）、空空导弹（AAM）这4种。
按目标种类分类
导弹分为防空导弹（攻击飞机）、反导导弹（攻击导弹，主要是弹道导弹）、反坦克导弹、反潜导弹、反辐射导弹（反雷达导弹）、潜射反潜导弹、潜射防空导弹等。
按射程分类
近程导弹：射程在1000公里以内；
中程导弹：射程1000至3000公里；
远程导弹：射程3000至8000公里；
洲际导弹：射程在8000公里以上。
按战斗部分类
核战斗部：核战斗部当量从10吨至一亿吨TNT不等。10吨至2万吨，射程1000km以内为战术核武器，2万吨以上，射程1000km以上为战略核武器。
常规战斗部：常规战斗部又分为冲击波破坏型爆破战斗部、动能撞击型杀伤战斗部、混合破坏型杀伤/爆破战斗部和子母战斗部等。另外还有一些战斗部不靠炸药的能量破坏目标，甚至不对目标造成硬杀伤，比如燃烧战斗部、电子干扰战斗部、电磁脉冲战斗部、石墨纤维战斗部等等。
此外，还有按导弹的某些性能分类的，如按速度分为亚音速导弹和超音速导弹，按运行高度分为低空导弹、中空导弹和高空导弹，按重量分为轻型导弹、中型导弹、重型导弹、便携式导弹等，按弹头数量分为单弹头和多弹头，多弹头又分为集束式、分导式、机动式3种类型。
