首先我们来看看地下暗河是怎么形成的，一般地讲，地表水沿着裂隙或破碎带（断层）下渗，在地下形成了具有与河流主要特征一样的水流，我们就称之为地下暗河，这在石灰岩地貌地区发育较完善，广西桂林地下河最为典型，其次还要受气候影响，热带雨林气候或（亚）热带季风气降水量丰沛，淋溶作用强，生物繁生，对地表破坏能力强，地表水渗漏后，往往也会形成地下暗河。
还有在地壳运动时期，内力作用下喷出或侵入的熔岩快速冷却，由于岩性不一，冷缩时形成溶洞或孔隙，在外力作用配合下也能形成地下暗河，这在自然界中也大有存在。
三峡地区地下暗河多吗？三峡库区不是石灰岩地貌，多为花岗岩构成的地壳结构，花岗岩致密坚硬，抗风化能力强，垂直节理发育，是理想库区或坝址的选择。但由于处于亚热带季节气候区，降水量多，风化作用强，也会形成一些地下暗河，但为数不多，那么三峡建成以后，对地下暗河有影响吗？
假如水库深100米，每平方米要承受100吨的压力，地表要承受着这么大的压力，对于风化壳比较薄的地下暗河，要产生挤压作用，会使地下暗河的流速加快，这将对地下生物鱼虾类的栖息环境起到破坏作用，这些鱼虾就要“背井离乡”，寻找更适合的环境，影响了它们的繁殖和生育。
这些地下暗河的河床长期在重力作用下，会慢慢被侵蚀掉，被磨平，最后与水库里的水融为一体，地下暗河的河口逐渐被抬高。还有的在库区的压力下依然保持原有地下暗河现状。
从三峡的地壳构成的岩石来看，库区为花岗岩，很少形成暗河，由花岗岩构成的地壳，本身不容易形成地下暗河，水库形成以后，这方面的影响非常小了。
如果库区为石灰岩对地下暗河影响就非常大了，反过来想，石灰岩地区也不能修建规模这么大的水库，也就是说水库坝址的选择不是说哪条河流，任何地点都可以建成水库的，这与地质构造、岩石构成直接相关，三峡水库从各方面条件来衡量，是水库坝址的最佳选择，也是上帝给我们的恩赐。
