企业经营组织形式的确立与改变，必将伴随着经营部门的划分，从而确立经营组织中各项任务与职责的归属。因此，经营部门划分的合理性也是经营组织诊断的一个课题。对经营部门的划分通常有以下几种方式：
1.根据人数划分。也就是根据人数的多寡来决定经营部门的设计。这种方式适用于企业中层、基层经营组织的划分。
2.根据经营职能划分。按企业经营职能划分组织部门是一种最广泛采用的方法。它具体的表明了企业经营活动的内容。由于绝大多数企业的基本职能都包括生产、销售和财务，所以它们不仅被当作部门组织的依据，而且更多地被当作组建企业基本部门的依据。这种划分方式的优点是：它是一个合乎逻辑并经过时间考验的办法，是最高主管部门的经理维护他们对企业基本活动的权利和权威性的最好办法；由于它遵循了职业专业化的原则，从而有利于劳动生产率的提高；它简化了训练工作，并且由于最高主管部门经理要对最终成果负责，因而按职能划分组织部门的方法，也为上级提供了进行严格管理的手段。缺点是：各个职能组织之间很难协调沟通，各职能组织的职员容易养成只忠于某个职能部门的态度和行为方式，而不能把企业当成一个整体来看待；总经理责任过于重大，因为只有他才能对盈利情况负责。
3.据地区划分。即按经营管理所在地区进行划分。这种划分方法特别适用于规模大的公司，或者业务活动在地理上分散的企业。按地区划分部门的目的是为了鼓励地方参与决策和取得地区化经营的效益。按地区划分组织部门的经济理由是考虑节约经营费用。为了降低运输费用，零部件制造厂与组装厂可以按地区划分的办法设置。恰当的布置仓库设施的坐落位置，可以减少交货时间。在销售旺季，缩短运货路程的任何一种销售路线，都同样会降低分配货物的费用。按地区划分组织部门的优点是：把责任下放到了基层；地区公司把重点放在本地的市场和问题上；有利于改善地区内的协调；具有地区经营的经济利益；能与本地的利益集团更好的就近当面联系；为经营管理人才提供可考虑的训练场所。缺点是：需要更多具有全面经营管理能力的人员；难以维持集中的经济服务工作；增加了最高主管部门的控制问题。
4.按照产品或产品系列组织业务活动，在经营多种产品的大型企业中早已显得日趋重要。一般说来，采取这种组织形式的企业最初是按职能形式组织的。随着企业的扩大，负责生产、销售、服务和工程等方面的主管人员遇到了大量由此而来的问题。他们的工作变得极端复杂，而管理幅度又限制他们不能增加在其直接领导下的下属主管人员的数目。从这点看来，有必要采取按产品划分组织部门的方法进行改组。向世界闻名的卡迪拉克汽车公司、雪佛兰汽车公司和通用汽车公司，就是按产品进行组织划分的。而大中型商业企业也采用这种划分方式。其优点是：可以把经营重点放在产品上；可以把利润责任放在分公司或产品部一级的位置上；可以改善职能业务活动的协调；能为总经理提供可用量化指标衡量的训练基地；允许产品或劳务的发展和变化。缺点是：要求更多的人具有全面经营管理才能；难以维持集中的经济服务工作；增加了高层主管部门的控制难度。
5.根据顾客划分。在许多不同类型的企业中都采用按顾客划分部门的方法。企业经理根据这种方法来安排业务，以迎合不同顾客的需要。向批发商和工厂出售产品的生产企业，常常发现这两类顾客的需要可以由专业化部门使其得到最大的满足。批发商依其产品质量可靠，可以继续订购，并且适合最终消费者的需要；而工厂需要价格低且质量高的产品。此外，还要求提供需求情况的调查、产品的安装与维修和对职工进行专门培训等服务项目。这种划分方法的最大优点是：以顾客需求为出发点，迎合顾客的兴趣偏好。缺点是使企业的专业人员和设备得不到充分利用，造成闲置浪费。
6.根据销售渠道划分。根据不同的经营渠道具体划分各职能部门，可划分为市场营销部、杂货部、家电部和化妆品部等。
分析经营部门的划分的合理性，应综合考察企业经营部门设置的依据、经营部门的业务性质、业务量大小、工作的技术含量、经营部门设置后的经营工作情况及外部环境的变化等因素，进而发现问题，提出改进方案。
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