病虫害是影响香菇产量和质量的一大因素，防治病虫害是香菇栽培的重要内容。病虫害防治以防为主，防治结合，主要是防。必须使用化学药物防治病虫害要选择国家允许的农药，严格按照国家规定的安全用药标准施用。
木霉又称为绿霉菌，主要有绿色木霉和康氏木霉，在危害香菇生长的所有杂菌中，木霉威胁最大。绿霉是在香菇生产过程中最易发生、危害极大的竞争性杂菌。如管理方法不当、防治不及时、会给香菇生产造成重大损失、甚至绝产绝收。
（1）病症
木霉（绿霉）侵害香菇培养基时，发病初期菌丝呈白色斑块逐渐变绿，后期为深绿色，菌落中央为墨绿色，向外逐渐变浅，严重的使菌袋培养基全部变成黑绿色并发臭松软。
（2）病因
①菌种感染。
②培养料灭菌不彻底，接种时没有达到无菌操作，违反操作规程造成污染。
③接菌工具、接菌室、发菌室消毒不彻底造成的感染绿霉。
④菌袋封闭不严，袋子破损造成绿霉污染。
⑤长期通风不良，空间相对湿度过高；高温高湿易感染绿霉。木霉在4～42℃范围内都能生长，发病适合温度20～32℃、偏酸环境、高温高湿利于绿霉菌的发生蔓延。在25摄氏度经2～3天菌落便长成绿色分生孢子。
（3）危害
木霉广泛分布于各种植物残体、土壤和空气中。木霉靠孢子传播，常借助气流、水滴、昆虫、原料、工具及操作人员的手、衣服等为媒介，侵入培养基内，一旦条件适宜就萌发繁殖为害。尤其是多年的菇场和老菇棚，常是木霉猖獗为害的场所。木霉适应性强，繁殖速度快，它本身能分泌毒素，抑制香菇菌丝生长；木霉还能生长在生长势减弱的香菇菌丝体上，使香菇组织细胞溶解死亡。
绿色木霉常发生在菌种和菌袋的培养基内及菌棒生长子实体阶段，与香菇争夺养分。受其污染后，养分受到破坏，严重的使培养基全部变成墨绿色，发臭松软，导致腐烂。
（4）防治
木霉至今没有理想的根治性药物，常用的杀菌药，对木霉只是抑制，而不是杀死，加大药量，只能同时杀死木霉和香菇菌丝。因此，创造适合香菇菌丝生长而不利于木霉繁殖的生态环境，是控制危害的根本措施。
①选择未被感染的高产优质抗逆性强的菌种。菌种如果被木霉危害，必须报废，即使轻度感病的菌种也应弃之不惜。
②培养料灭菌一定要彻底，培养料预湿要均匀，才能彻底灭菌。当炉温降至80℃时出炉进行检查，如有破损及时用透明胶布贴好封严、以防感染及其它杂菌。
③接种时严格执行无菌操作。15～20米2接种室在接种18小时前用38％的甲醛500克进行薰蒸消毒、接种工具放在密封的接种箱中用15～20克菇宝消毒30分钟、15～20米2发菌室在前一天用硫磺薰蒸，然后再用500克甲醛进行薰蒸消毒。
④使用甲醛等酸性消毒剂不要太过量，以免造成酸性环境。
⑤菌袋面发现绿霉，可用75%的酒精或2%甲醛和2%石碳酸混合液或l－2％来苏儿液、0.1％甲基托布津、0.1－0.2％代森锌等药剂装入针筒注入受害处。若在脱袋后菌筒上发现，第一天用0.2％多菌灵溶液涂抹于受害部位及四周，第二天再用5％石灰上清液重涂于患处，即可杀灭。如果菌棒1／3被侵害时，可用刀切除污染部分，切口用500倍波尔多液涂抹或浸泡消毒。
⑥一旦发生木霉为害，要立即通风降湿，以抑制木霉菌的扩展，处于发菌阶段的培养料感病以后，可采用注射药液的方法抑制木霉扩张，常用的药液有5％的石碳酸、2％的甲醛、1：200倍的50％多菌灵、75％甲基托布津、pH值为10的石灰水，此外，往污染处撒白灰面，防治效果也很好。
⑦甲醛防治，当前甲醛是防治香菇绿霉菌效果比较明显的药剂。当绿霉菌斑块直径1厘米大小时、用注射器抽取1．5毫升比例为1∶1的甲醛与酒的混合物沿菌斑注射5针；当绿霉菌斑块直径4厘米大小时，用注射器抽取4毫升比例为1∶1的甲醛与酒的混合物沿菌斑注射12针，这样绿霉菌即可得到有效控制。
⑧利用温度防治绿霉：香菇菌丝生长最佳温度为22～24℃、而绿霉菌超过23℃最易感染发生。所以我们根据香菇菌丝和绿霉菌所需最适温度不同进行控制、避免高温环境、采取措施如下：
a.室内着菌期。疏散菌袋降低堆叠层次。刺孔要分批进行、刺孔后香菇菌丝呼吸作用增强释放热量，当室温达28℃时停止刺孔。
b.越夏期。越夏期间外界环境温度高达30℃以上，必须做好通风降温工作。若在出菇棚中度夏，棚高最好达2．8米，后墙每隔12～1．5米留60厘米×60厘米通风孔。棚膜前底脚全部揭起，棚膜上覆盖草帘遮挡阳光、排放菌袋的架下挖50厘米宽20厘米深地沟，内衬塑料薄膜，如遇高温沟内放水，向草帘棚周围地面喷水降温。棚内地面洒石灰降低湿度。
c.个别菌袋感染绿霉时，初期应及时处理，置感染菌袋于24℃以下通风良好的地方，或把菌袋感染绿霉的一面贴近阴凉地面或放在有水的地沟上，这样香菇菌丝会迅速生长吃掉绿霉菌。绿霉发病后期，香菇菌袋部分变成墨绿色且松软腐烂变质没有保存价值的、用刀齐面切除后用黄泥封严、这样处理后未被感染部分可正常生长，效果很好。
