三清山始终与道教有密切的关系。三清山道教文化开始于晋代葛洪，葛洪在三清山拥有特殊地位。据史书记载，东晋升平年间(357-361)年，炼丹术士、著名医学家葛洪与李尚书上三清山结庐炼丹，著书立说，宣扬道教教义，至今山上还留 有葛洪所掘的丹井和炼丹炉的遗迹。尤其是那口丹井，历时一千余载，依然终年不涸，其水汪洌味甘，被后人称之为“仙井”。于是葛洪便成了三清山的“开山始祖”，三清山道教的第一位传播者。
时至唐朝，道教被朝廷奉为国教，士穿行往返于大江南北，三清山的道教也随之兴盛起来，香火不断，朝山香客络绎不绝。唐(周)圣元年(639)年，衢州须江(今称为江山市)之南乡、常山之西乡和饶州弋阳之东乡，设玉山县，遂将三清山划为玉山县所辖。其后，方士将化缘所得，在葛洪结庐炼丹之处营建了三清山上第一座道教建筑--老子宫观(此观被称为“三清福地”)，进一步巩固了三清山在道教史上的重要地位。
北宋宁真宗笃信道教，奉老子为太上老君混元上德皇帝。此时，在三清山一带开始出现成批的道教建筑。方士们为了纪念葛洪开山之功，在山上建起了葛仙观，内中供奉葛仙翁和李尚书石像;同时建起的还有福庆观、灵济庙。尤其值得一提的是，方士们在天门峰的悬崖之上，用天然花岗岩雕干砌成一座六层五面的风雷塔，此塔历尽千年风雨，至今巍然不动，被誉为三清山上道教建筑中的一颗灿烂明珠。
元时道教进一步受到重视。他们专门从事道教活动，他们受道教经典戒规约束，谙熟各种醮祷仪式，在民间从事道教活动：据元人鲁起元在《游三清山记》中说 , 此时三清山正在大动土木，扩建三清观。观内供奉石刻石仙君、葛仙翁、李尚书、金童、玉女、潘元帅神像;山上景物、地点也以道教称谓命名，如仙人桥、雷公 石、判官石等等。由此可见当时三清山上兴盛一斑明太祖朱元璋特别推崇道教。
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