他的思想成熟，富含哲理，是一位理性主义者，而不是迷信的崇拜者；是一位经验论者，而不是诡辩学者。
培根是新贵族的思想代表，反对君权神授的制度，主张限制王权。他对中世纪的经院哲学，提出必须清除它给人们造成的错误认识的假象，为真正的科学清扫道路。
他继承了古代唯物主义传统，承认自然界是物质的，认为构成一切事物的最小单位是分子，是事物的基本性质，实物形态各异都是由它的不同排列和组合构成的，而运动是物质固有的最重要的特性。
培根的哲学贡献在于提出唯物主义经验论的基本原则，他称事物运动的规律和规定性为形式，认为感觉是认识的开端，是一切知识的源泉。他重视科学实验在认识中的作用，认为必须借助于实验，才能弥补感官的不足，深入揭露自然的奥秘。他重视归纳法，强调它的作用和意义，认为它是唯一正确的方法。
弗朗西斯·培根在近代哲学史上是一位具有划时代意义的人物，是从古代唯物论向近代唯物论转变的先驱。但他的哲学思想有一定局限性，他把自然科学中孤立静止的研究方法移植到哲学上来，造成了欧洲近代哲学的狭隘。他的哲学具有神学性，主张双重真理，承认上帝存在和灵魂不死等宗教思想。
