病理性肥胖包括的范围比较广，但主要指由于某种疾病引起的肥胖，如柯兴氏综合征、甲减性肥胖、肝炎后肥胖等，单纯性肥胖出现较严重的并发症也意味着肥胖已成为病理性肥胖。
柯兴综合症原因： 肾上腺皮质功能亢进，皮质醇分泌过多 现象：脸，脖子和身体肥大，但四肢则脂肪不多。
胰源性原因： 胰岛素分泌过多，代谢率降低，使脂肪分解减少而合成增加 现象： 全身肥胖。
性功能降低原因： 脑性肥胖病，伴有性功能丧失，或性欲减退。现象： 乳房，下腹部，生殖器附近肥胖。
垂体性原因： 脑垂体病变导致垂体前叶分泌过多生长激素 现象： 全身骨头，软组织，内脏组织增生和肥大。
甲状腺功能减退原因： 甲状腺功能减退现象： 肥胖和粘液型水肿。
药源性原因： 药物的副作用引起，如由肾上腺皮质激素类药物。 现象：在服药一段时间后出现的肥胖，比如有些患有过敏性疾病，类风湿病，哮喘病的病人。
（1）脑部病变如外伤、肿瘤、炎症后;
（2）活动减少或障碍如长期卧床、脑瘫;
（3）骨骼生长障碍如软骨发育不良;
（4）药物：如类固醇激素、抗甲状腺药物、胰岛素等。
（5）肥胖相关基因突变如瘦素和瘦素受体、FTO基因突变;
（6）内分泌异常如生长激素缺乏症、高皮质醇血症、高胰岛素血症;
（7）某些综合征如肥胖性腺发育不良，多指趾、视网膜炎智力落后综合征；
