在西南旱灾中成为NPO领头羊的云南省大众流域管理研究及推广中心（以下简称“云南大众流域”），在玉树地震发生后数小时内便成立西宁NPO救灾协调办公室的青海省民和回族土族自治县残障人士医疗康复保健中心（以下简称“民和残障人康复中心”），分别是南都基金会协办的“世界银行发展市场项目”和“新公民计划”公益项目资助过的民间组织，他们在应对自然灾害中的出色表现，体现了南都基金会努力以本土资源支持民间组织发展的积极成果。
草根组织长期在基层活动，对灾情敏感。诸如云南大众流域、润土互助工作组等云南本地民间组织，早在政府和舆论大力关注西南旱情之前就开始了防范和救助的活动。这次西南旱情并非突如其来，早在2009年9月，长期活跃在基层的云南大众流域负责人于晓刚在看到云南省玉龙纳西族自治县拉市地区的水库时就已经预见到2010年的大旱。当时，水库的蓄水量只有往年的一半，他向自己参与组建的拉市乡东灌渠用水户协会建议，必须“舍小春，保大春”。据媒体报道：“2600多名当地村民是这个用水户协会的会员，用水规划需经过集体同意。他们决定听从于晓刚的建议。‘去年下半年应该放4道水，最后只放了一道水’，并且放弃耗水的小麦种植，全力灌溉当时正在冬眠、需水量较少的果树。半年前的预测如今已得到证实，海东村的村民们正在庆幸他们作出了正确的选择，‘说不定，今年还能种上辣椒、苹果和冬桃’。”这与旱区不少村民面临绝收，甚至可能因旱致贫的局面形成了鲜明的对比。
作为最贴近震区的民间组织，青海省民和残障人康复中心在玉树震后一小时就开始了行动。他们派员进入玉树参与紧急救援，并在省城西宁设立救灾协调办公室，同时呼吁其他NPO也采取必要的救助措施。格桑花西部助学网、青海省社工协会、乐平心理咨询中心等6家本土NPO，以及陕西、甘肃、四川的部分NPO相继加入了西宁救灾协调办公室。由于地理和发展原因，青海省的民间组织一直不很发达，一是数量少，且NPO主要集中在民和、西宁等地，玉树在震前也是NPO活动较多的地区；二是资源获取渠道缺乏，缺少同基金会等资助机构打交道的经验和能力。因为曾接收过新公民计划的资助，也有和其他资助机构沟通的经验，民和残障人康复中心便义务替格桑花西部助学网、乐平心理咨询中心等NPO承担起了向南都基金会申请项目资助的工作，让后者可以全心投入到抗震救灾中去。玉树抗震紧急救援过程中，民和残障人康复中心承担起了信息枢纽的作用，高效地串联了前后方的信息和资源。该中心负责人祁永金地震以来几乎每天都有相应的信息、救灾提示发布出来，如：《进入玉树救灾谨防高原反应》、《参与玉树救灾重建 谨防当地藏獒野狗》、《参与玉树救灾的部分NPO联系方式》、《玉树救灾重建倡议和建议征集》等。考虑到玉树地区的特殊情况，他们还计划编发《NPO参与玉树重建参考手册》为其他民间组织服务。
随着政府救援力度的加大，NPO把工作方向放在了政府顾不到的事，忙不过来的地方，协助政府做好救灾工作。玉树地震民间行动中心将在志愿者资源安排、后勤保障、物资购置、NPO联络、救援信息平台建设、一线资料收集、与政府协调、中心内部协调等方面完成架构，落实责任人，投入工作。可以预计，在灾后重建阶段，NPO还将发挥更大的作用。
南都基金会启动“灾害救援和灾后重建基金”，为民间组织参与抗震抗旱救灾开辟绿色通道，重点资助通常较难筹集的人力成本、行政成本和物流经费，为民和残障人康复中心、格桑花西部助学网这样的草根NPO解了燃眉之急。不过，对正在一线抗震抗旱的民间组织来说，这样的本土资源还显得太少。南都基金会副理事长兼秘书长徐永光表示：南都基金会愿意成为民间组织的坚强后盾，以本土资源支持民间组织参与紧急救援和灾后重建，也希望有更多的本土基金会支持灾区民间组织在灾后重建中长期坚持下去。
根据南都基金会理事会通过的新的战略规划，南都基金会将加大对支持性机构和引领性机构的资助。西南抗旱和玉树抗震中涌现出来的这些优秀机构，南都基金会无疑将给予积极扶持，促进西部地区本土民间组织的发展。
