法官程序违法属于审判阶段程序性违法，一般的处理意见是发回重审，法官在法院内部接受处罚。
法官程序违法属于故意违反法律、审判纪律、审判管理规定拖延办案，或者因过失延误办案，造成严重后果的，依照《人民法院工作人员处分条例》第四十七条的规定予以处分。故意违反规定拖延办案的，给予警告、记过或者记大过处分;情节较重的，给予降级或者撤职处分;情节严重的，给予开除处分。
根据《民事诉讼法》第147条、140条之规定：当事人不服地方人民法院第一审判决的，有权在判决书送达之日起十五日内向上一级人民法院提起上诉。当事人不服地方人民法院第一审裁定的，有权在裁定书送达之日起十日内向上一级人民法院提起上诉。可以提起上诉的裁定包括不予受理、对管辖有异议、驳回起诉三种情形。
根据《刑事诉讼法》第182条、183条之规定：刑事公诉案件被害人及其法定代理人不服地方各级人民法院第一审判决的，自收到判书后五日以内，有权请求人民检察院提起抗诉。不服判决的上诉和抗诉期限为十日，不服裁定的上诉和抗诉期限为五日，从接到判决书、裁定书的第二日起算。
二、控告法官违法办案的投诉部门
1、本院纪检部门
负责指导本院纪检、监察工作;对本院工作人员贯彻执行法律、法规和上级决定、规定的情况进行监督;受理对本院及其工作人员违反纪律、法律行为的控告、检举，并按照管理权限进行查处;受理检察人员不服处分决定的申诉。
2、上级法院
从《中华人民共和国人民法院组织法》的规定看，上下级法院之间的关系表述为监督与被监督关系更加准确。《中华人民共和国人民法院组织法》第十七条规定了，下级人民法院的审判工作受上级人民法院监督。
对于案件本身来说，认为法官违法判案，可以向上级法院上诉;判决已经生效的，可以申请法院再审予以纠正。
3、纪委
上级纪律检查委员会有权检查下级纪律检查委员会的工作，并且有权批准和改变下级纪律检查委员会对于案件所作的决定。如果所要改变的该下级纪律检查委员会的决定，已经得到它的同级党的委员会的批准，这种改变必须经过它的上一级党的委员会批准。
4、纪检监察机关
受理对国家行政机关及其公务员和国家行政机关任命的其他人员违反行政纪律行为的控告、检举;调查处理国家行政机关及其公务员和国家行政机关任命的其他人员违反行政纪律的行为;受理国家行政机关公务员和国家行政机关任命的其他人员不服主管行政机关给予处分决定的申诉，以及法律、行政法规规定的其他由监察机关受理的申诉;
法官明显违法判案的，可以对法官进行投诉、举报，由纪检监察机关对其进行纪律处分，构成犯罪的，依法追究刑事责任。
法官在进行办案的时候，一定要按照公平公正的原则依法审理案件，我们对于法官的办案存在异议，是可以通过本院纪检部门、上级法院、纪委以及纪检监察机关进行投诉的。
