正是在无数医学家的临床实践和不断进行总结的基础上，在战国晚期出现了一部内容丰富的医学理论著作《黄帝内经》（以下简称《内经》），它既非记述一时之言，又非出自一人之手，而是一个时代医学进展的总结性巨著。《内经》包括《素闷》和《灵枢》两部分，共18卷，162篇。它以人体解剖、生理、病理、病因、诊断等基础理论为论述重点，兼顾针灸、经络、卫生保健等多方面的内容，为祖国医学理论体系的形成奠定了广泛的基础。
《内经》认为人体器官各有不同的功能，它们既相区别又相联系，构成一具有机的整体。这种整体观认为，人体某部分发生病变，可以影响到整个身体或其他器官，而全身的状况又可以影响到局部的病理变化。《内经》又把人体放在一定的外界环境中进行考察与研究，在论及医学的几乎所有基本问题时，处处结合四时季节、地理水土、社会生活、思想情绪等方面的变化，形成人体与外界环境相互感应的观点。这些整体观念是《内经》，也是中国传统医学指导临床实践的重要思想方法之一。
在祖国医学史上，《内经》占据有重要的地位，它初步建立了祖国医学的理论体系，一直指导着中医的临床实践。历代出现的许多著名的医学著作和有创见的医学流派，为祖国医学增添了新内容，但就其学术思想的继承性来讲，主要是在《内经》的基础上发展起来的。直到今天，研究和学习《内经》，对于继承发扬祖国医学宝贵遗产，仍有着重要的意义。《内经》作为一部科学名著，早已引起了国外医学科学家的重视，它的部分内容，已相继译成日、英、德、法等国文字。
