《部队经济适用房规定》第三十四条： 购买军队经济适用住房的，付清购房款后拥有全部产权。产权手续的办理，按照建设部、总后勤部的有关规定，由售房单位集中到地方房地产管理部门办理。所购住房需要上市交易的，实行准人制度，在补交土地使用权出让金或者所含土地收益，及按照国家和地方人民政府规定交纳有关税费后，其余收入归个人所有。
可以明确知道，若军用土地上的经适房需要上市交易的话，实行准人制度，是需要按照国家和地方人民政府规定交纳相关税费。可惜，就土地使用费而言，国家目前没有统一的规定，需要所购住房所在地的人民政府规定。
土地使用者因使用土地而向土地所有者支付的费用，是土地使用者获得用地应付出的代价。中外合资、合作经营企业无论新征用土地，还是利用中方合资者或合作者原使用的土地，都应缴纳土地使用费，外资企业在领取土地证书时，也应向其所在地的土地管理部门缴纳土地使用费。
综上，经适房军用土地费用谁出，是需要具体问题具体分析的。有一种情况是，自己住，那就不存在这项费用了。但如果满了5年后，需要进行买卖，则需要补交土地使用费和相关政府部门规定的一些费用，但具体的缴纳标准，全国没有统一的标准，具体的则需要根据房屋所在地的政府规定的缴纳。
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