先办离职手续，再申请仲裁。经济补偿或者赔偿金是在解除或者终止关系以后才产生的，所以应当想办理离职，办理离职时用人单位未支付经济补偿金或者赔偿金的，劳动者可以申请劳动仲裁。劳动者应当按照双方约定，办理工作交接。用人单位依照本法有关规定应当向劳动者支付经济补偿的，在办结工作交接时支付。
《劳动合同法》
第五十条
用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。
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