简单枚举归纳推理和科学归纳推理都属于不完全归纳推理，它们的前提都是只对某类事物的部分对象进行考察；
同时，它们都是通过断定部分对象具有或不具有某种属性推出该事物的全部对象具有或不具有该属性的，所以其结论断定的范围都超出了前提断定的范围。
这是它们相同的地方。它们的区别主要表现在以下几个方面：
第一，它们推出结论的根据不同。
简单枚举归纳推理主要是以经验为基础，通过对某类事物的重复性观察而认识事物；而科学归纳推理则是在科学分析的基础上，对考察对象与其属性之间的关系进行探讨，从而推出结论的。
第二，它们所得结论的可靠性不同。
简单枚举归纳推理的结论以经验为基础，以没有遇到反例为成立的条件，这就注定了它在可靠性上的不足，大多数时候只有参考价值；而科学归纳推理的结论则是在对考察对象与其属性之间的必然关系进行科学分析的基础上得出的，显然比简单枚举归纳推理的结论可靠得多。
第三，它们对前提的要求不同。
对简单枚举归纳推理来说，前提所断定的考察对象的数量越多、范围越广，其结论就越可靠；而对科学归纳推理来说，前提中考察对象与其属性之间的必然关系才是其结论可靠性的重要保证，而考察对象的数量与范围则是次要的。
