1、融资渠道单一，融资困难
中小企业“融资难”特别是“贷款难”问题成为阻碍其可持续发展的顽症。虽然政府部门出台相关政策加以扶持，但从中小企业的发展现状看，贷款难、担保难的问题依然突出。由于银行是企业化经营，更多的考虑的是效益，只能是锦上添花，不可能雪中送炭。另外在企业可持续发展战略分析中，中小企业在市场经济条件下易受经营环境影响，加之民营企业资金需求一次性量小、频率高，增加了融资的成本和代价，不可避免地存在中小企业融资难的问题。
2、技术创新能力薄弱
在企业可持续发展战略分析中，中小企业在可持续发展过程中，创新能力已经成为制约中小企业提高产品附加值，拓宽市场领域，提升国际竞争力的瓶颈。在企业可持续发展战略分析中，究其原因主要有：首先是核心技术创新需要投入大量研发资金，并且其创新结果又具有很强的不确定性，而中小企业资金并不充裕，难以独立完成；在企业可持续发展战略分析中，其次知识产权保护虽有显著改进，在企业可持续发展战略分析中，尚未形成国民的法治意识和自觉行为，创新维权成本过高，导致创新投入与创新收益严重不对称，极大地挫伤了中小企业创新的积极性；最后是创新人才的供求严重失衡。一方面，中小企业需要大量的创新人才，另一方面，我国高等院校的人才培养模式与中小企业的客观需求严重脱节。
3、运作体制落后，管理制度不规范
在企业可持续发展战略分析中，绝大多数中小企业属于家族制企业，这在市场经济的初始阶段有其历史的必然性。它的内部结构简单，管理层次较少，成员间具有较高的信任度，企业内部具有较强的合作能力，在经营上也具有较高的效率和灵活性。因此，在企业创建时期，与其他企业组织形式相比，在资本筹集、管理效率、信息搜集和监督成本上，都具有明显的优势。但是随着市场经济的发展，当中小企业发展到一定规模以后，家族制企业中原来有利于企业发展的一些积极因素逐步转变为消极因素，由血缘关系、亲缘关系、地缘关系而产生的宗法性和封闭性特征，极大地制约着中小企业的进一步发展。
4、管理能力不足，企业文化精神模糊
中小企业老板的综合素质存在一些不容忽视的缺陷，如小农思想严重，缺乏事业心和社会责任感；思维方式单一，具有盲目冲动的倾向，缺乏对企业发展战略的思考，缺乏系统的现代管理知识和向现代企业家过渡的文化底蕴，持续发展的能力不足等等，在企业可持续发展战略分析中，这些源于中小企业管理者受传统封建文化的影响，实行家长制管理。此外企业中人情风盛行，拉帮结派，是非不明，企业精神模糊，企业目标单一，也是制约企业发展的重要因素。
